Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znrf3Q5SSZ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms