Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TefmQ5SSK3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TefmQ5SSK3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms