Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r223Q5SSA0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms