Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf215Q5SPX3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf215Q5SPX3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf215Q5SPX3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf215Q5SPX3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf215Q5SPX3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms