Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms