Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms