Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xaf1Q5NBU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xaf1Q5NBU8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms