Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DroshaQ5HZJ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DroshaQ5HZJ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DroshaQ5HZJ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms