Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prkaa1Q5EG47 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms