Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8bQ5DU41 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms