Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnl1Q52KE7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnl1Q52KE7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms