Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3lQ4KL14 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc3lQ4KL14 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms