Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx49Q4FZF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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