Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q499E6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q499E6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms