Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt35Q497I4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt35Q497I4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms