Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Garnl3Q3V0G7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Garnl3Q3V0G7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms