Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rimbp3Q3V0F0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rimbp3Q3V0F0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rimbp3Q3V0F0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms