Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933416C03RikQ3V063 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933416C03RikQ3V063 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms