Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330034G19RikQ3UWX6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330034G19RikQ3UWX6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms