Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SfswapQ3USH5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms