Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28047Q3US59 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28047Q3US59 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms