Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms