Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skap2Q3UND0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skap2Q3UND0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms