Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cog7Q3UM29 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms