Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smu1Q3UKJ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smu1Q3UKJ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms