Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Greb1Q3UHK3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Greb1Q3UHK3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms