Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zswim8Q3UHH1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zswim8Q3UHH1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms