Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnrc6cQ3UHC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnrc6cQ3UHC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms