Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4G0

Uncharacterized protein C15orf41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U4G0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3U4G0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U4G0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U4G0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms