Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam117bQ3U3E2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Fam117bQ3U3E2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Fam117bQ3U3E2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Fam117bQ3U3E2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam117bQ3U3E2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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