Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorlQ3U285 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorlQ3U285 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms