Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3U1D9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms