Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc174Q3U155 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc174Q3U155 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc174Q3U155 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms