Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmd1Q3TXS7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd1Q3TXS7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmd1Q3TXS7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms