Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccndbp1Q3TVC7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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