Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca4Q3TKT4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca4Q3TKT4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms