Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDD9

Ppp1r21, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r21Q3TDD9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r21Q3TDD9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r21Q3TDD9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r21Q3TDD9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r21Q3TDD9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r21Q3TDD9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r21Q3TDD9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r21Q3TDD9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r21Q3TDD9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms