Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna5Q2MKA5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms