Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pate4Q09098 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms