Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cass4Q08EC4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms