Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HgfQ08048 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HgfQ08048 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms