Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2Q07279 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms