Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms