Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms