Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms