Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl1Q02067 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms