Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EgfrQ01279 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EgfrQ01279 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms