Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2bQ01097 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2bQ01097 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms