Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms