Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GabpaQ00422 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms